На мой взгляд, лучшее объяснение механизмов действия вирусов в организме имеется в видео:
тайная Вселенная. Путешествие внутрь клетки / Secret Universe: The Hidden Life of the Cell
Думаю, после просмотра станет понятнее механизм внедрения в клетку, проникновения в ядро и производства новых вирусов.